UJI AKTIVITAS ANTIKANKER PAYUDARA SENYAWA ANDROGRAFOLIDA DARI TUMBUHAN SAMBILOTO (Andrographis paniculata (Burm F) Ness.) TERHADAP HUMAN EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR 2 (HER-2) SECARA IN SILICO

Sintya Suherlan; Rohayah Rohayah; Taufik Muhammad Fakih

doi:10.29313/jiff.v4i2.7784

UJI AKTIVITAS ANTIKANKER PAYUDARA SENYAWA ANDROGRAFOLIDA DARI TUMBUHAN SAMBILOTO (Andrographis paniculata (Burm F) Ness.) TERHADAP HUMAN EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR 2 (HER-2) SECARA IN SILICO

Sintya Suherlan, Rohayah Rohayah, Taufik Muhammad Fakih

Abstract

Kanker payudara merupakan suatu keadaan dimana sel telah kehilangan pengendalian dan mekanisme normalnya, sehingga terjadi pertumbuhan yang tidak normal, cepat, dan tidak terkendali pada jaringan payudara. Kanker payudara dapat menyebabkan kematian pada kaum wanita. Andrographolide merupakan salah satu senyawa antikanker yang terkandung pada tanaman sambiloto (Andrographis Paniculata (Burm F) Ness.). Adapun reseptor Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (HER-2) merupakan resepor yang memiliki peranan penting pada kanker payudara. Tujuan pada peneitian ini adalah untuk mengetahui afinitas dan interaksi antara senyawa Andrographolide dan Dendronpholide G dengan reseptor HER-2 secara in silico. Pada penelitian ini dilakukan identifikasi sifat fisikokimia senyawa Andrographolide dan Dendronpholide G dengan menggunakan server swiss-ADME. Kemudian senyawa tersebut dioptimasi menggunakan software Avogadro. Setelah mendapatkan konformasi senyawa uji terbaik kemudian dilakukan tahap selanjutnya yaitu simulasi molecular docking menggunakan reseptor HER-2 terhadap senyawa uji menggunakan software MGL Tools 1.5.6 yang dilengkapi Autodock Tools 4.2. Adapun hasil penelitian yang diperoleh yaitu interaksi yang terjadi pada senyawa uji Andrographolide menghasilkan energi bebas ikatan sebesar −5,42 Kcal/mol dan nilai konstanta inhibisi 105,72 nM, sedangkan Dendranpholide G menghasilkan energi bebas ikatan sebesar −3,67 Kcal/mol dan nilai konstanta inhibisi 2,05 µM. Interaksi pada senyawa Andrographolide dan Dendranpholide G dengan reseptor HER-2 yaitu 1 ikatan hidrogen (MET801) dan terdapat 4 interaksi hidrofobik (MET801, LEU726, ALA751, LEU852). Hasil dari simulasi molecular docking dapat diprediksi bahwa senyawa Andrographolide memiliki afinitas yang baik dibandingkan senyawa Dendranpholide G maka dapat dinyatakan sebagai kandidat antikanker payudara.

Keywords

Kanker Payudara, Andrographolide, Dendronpholide G, Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (HER-2), Molecular Docking

Full Text:

PDF (Bahasa Indonesia)

References

Aertgeerts, K., Skene, R., Yano, J., Sang, B. C., Zou, H., Snell, G., Jennings, A., Iwamoto, K., Habuka, N., Hirokawa, A., Ishikawa, T., Tanaka, T., Miki, H., Ohta, Y., & Sogabe, S. (2011). Structural analysis of the mechanism of inhibition and allosteric activation of the kinase domain of HER2 protein. Journal of Biological Chemistry, 286(21): 18756−18765.

Benet, L. Z., Hosey, C. M., Ursu, O., & Oprea, T. I. (2016). BDDCS, the Rule of 5 and drugability. In Advanced Drug Delivery Reviews, 101: 89−98.

Berdan, C. A., Ho, R., Lehtola, H. S., To, M., Hu, X., Huffman, T. R., Petri, Y., Altobelli, C. R., Demeulenaere, S. G., Olzmann, J. A., Maimone, T. J., & Nomura, D. K. (2019). Parthenolide Covalently Targets and Inhibits Focal Adhesion Kinase in Breast Cancer Cells. Cell Chemical Biology, 26(7): 1027−1035.

BP Basuki. (2015). Dasar-dasar Urologi. In Revue medicale suisse, 11: 456–457.

Chen, X., Li, H., Tian, L., Li, Q., Luo, J., & Zhang, Y. (2020). Analysis of the Physicochemical Properties of Acaricides Based on Lipinski’s Rule of Five. Journal of Computational Biology, 27(9): 1397−1406.

Darusman, F., Fakih, T. M., & Nurfarida, G. F. (2021). Identification of the Glimepiride and Metformin Hydrochloride Physical Interaction in Binary Systems. Borneo Journal of Pharmacy, 4(2): 110−116.

Day, W. C., Agency, I., Day, W. C., Atomic, I., & Agency, E. (2021). Breast cancer now most common form of cancer: WHO taking action. World Health Organization, December 2020.

Fakih, T. M., Arumsari, A., Dewi, M. L., Hazar, N., & Syarza, T. M. (2021). Identifikasi Mekanisme Molekuler Senyawa Ftalosianina sebagai Kandidat Photosensitizer pada Terapi Fotodinamika secara In Silico. ALCHEMY Jurnal Penelitian Kimia, 17(1): 37−42.

Gyebi, G. A., Ogunro, O. B., Adegunloye, A. P., Ogunyemi, O. M., & Afolabi, S. O. (2021). Potential inhibitors of coronavirus 3-chymotrypsin-like protease (3CLpro): an in silico screening of alkaloids and terpenoids from African medicinal plants. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 39(9): 1–13.

Haslam, A., & Prasad, V. (2019). Estimation of the percentage of us patients with cancer who are eligible for and respond to checkpoint inhibitor immunotherapy drugs. In JAMA Network Open, 2(5): e192535.

Hirota, M., Ashikaga, T., & Kouzuki, H. (2018). Development of an artificial neural network model for risk assessment of skin sensitization using human cell line activation test, direct peptide reactivity assay, KeratinoSensTM and in silico structure alert parameter. Journal of Applied Toxicology, 38(4): 514–526.

Johnson, S. C., Dweck, C. S., Chen, F. S., Stern, H. L., Ok, S. J., & Barth, M. (2010). At the intersection of social and cognitive development: Internal working models of attachment in infancy. Cognitive Science, 34(5): 807–825.

Kemmish, H., Fasnacht, M., & Yan, L. (2017). Fully automated antibody structure prediction using BIOVIA tools: Validation study. PLoS ONE, 12(5): e0177923.

Kontoyianni, M., McClellan, L. M., & Sokol, G. S. (2004). Evaluation of Docking Performance: Comparative Data on Docking Algorithms. Journal of Medicinal Chemistry, 47(3): 558–565.

Li, L., Yue, G. G. L., Lee, J. K. M., Wong, E. C. W., Fung, K. P., Yu, J., Lau, C. B. S., & Chiu, P. W. Y. (2017). The adjuvant value of Andrographis paniculata in metastatic esophageal cancer treatment - From preclinical perspectives. Scientific Reports, 7(1): 854.

Mahanthesh, M. ., Ranjith, D., Yaligar, R., Jyothi, R., Narappa, G., & Ravi, M. (2020). Swiss ADME prediction of phytochemicals present in Butea monosperma (Lam.) Taub. Journal of Pharmacognosy and Phytochemistry, 9(3): 1799–1809.

Motaparthi, K., Stanisic, V., Van Voorhees, A. S., Lebwohl, M. G., & Hsu, S. (2014). From the medical board of the national psoriasis foundation: Recommendations for screening for hepatitis B infection prior to initiating anti-tumor necrosis factor-alfa inhibitors or other immunosuppressive agents in patients with psoriasis. Journal of the American Academy of Dermatology, 70(1): 178–186.

Norel, R., Sheinerman, F., Petrey, D., & Honig, B. (2008). Electrostatic contributions to protein-protein interactions: Fast energetic filters for docking and their physical basis. Protein Science, 10(11): 2147–2161.

Petit, J., Meurice, N., Kaiser, C., & Maggiora, G. (2012). Softening the Rule of Five - Where to draw the line? Bioorganic and Medicinal Chemistry, 20(18): 5343–5351.

Priani, S. E., & Fakih, T. M. (2021). Studi Interaksi Molekular Senyawa Hesperidin dan Nobiletin dari Kulit Buah Jeruk terhadap Enzim Tyrosinase secara In Silico. Jurnal Ilmiah Farmasi Farmasyifa, 4(1): 17–24.

Qasaymeh, R. M., Rotondo, D., Oosthuizen, C. B., Lall, N., & Seidel, V. (2019). Predictive binding affinity of plant‐derived natural products towards the protein kinase g enzyme of mycobacterium tuberculosis (Mtpkng). Plants, 8(11): 477.

Ramadhan, D. S. F., Fakih, T. M., & Arfan, A. (2020). Activity Prediction of Bioactive Compounds Contained in Etlingera elatior Against the SARS-CoV-2 Main Protease: An In Silico Approach. Borneo Journal of Pharmacy, 3(4): 235–242.

Tanbin, S., Fuad, F. A. A., & Hamid, A. A. A. (2021). Virtual screening for potential inhibitors of human hexokinase ii for the development of anti-dengue therapeutics. In High-Throughput, 10(1): 1.

Wang, Z., Mori, K., Nakajima, K., & Narita, F. (2020). Fabrication, modeling and characterization of magnetostrictive short fiber composites. Materials, 13(7): 1494.

Yoshimoto, S., Kato, D., Kamoto, S., Yamamoto, K., Tsuboi, M., Shinada, M., Ikeda, N., Tanaka, Y., Yoshitake, R., Eto, S., Saeki, K., Chambers, J., Hashimoto, Y., Uchida, K., Nishimura, R., & Nakagawa, T. (2020). Overexpression of human epidermal growth factor receptor 2 in canine primary lung cancer. Journal of Veterinary Medical Science, 82(6): 804–808.

DOI: https://doi.org/10.29313/jiff.v4i2.7784